（幕啟：月光下的廢棄教堂，彩色玻璃投下斑駁光影。灰原哀被反綁在祭壇前，琴酒用匕首挑起她一縷茶色頭發(fā)）
琴酒：（低語(yǔ)）雪莉，組織不需要背叛者的基因延續(xù)。（轉(zhuǎn)向陰影）苦艾酒，把那個(gè)女孩帶過(guò)來(lái)。
（苦艾酒推著被迷暈的步美從側(cè)幕走出，步美頸間螢火蟲(chóng)吊墜閃爍微光）
灰原哀：（瞳孔收縮）你們居然對(duì)小孩子...
（教堂穹頂突然傳來(lái)柯南變聲器的回響）
柯南：（畫(huà)外音）游戲該結(jié)束了，Gin。你們要找的APTX4869永久解藥配方，早就被分解成三份密碼。
（赤井秀一與安室透持槍從二樓回廊現(xiàn)身，槍口紅光瞄準(zhǔn)琴酒心臟）
安室透：（冷笑）你們永遠(yuǎn)猜不到，最后的關(guān)鍵在螢火蟲(chóng)發(fā)光酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。
（祭壇下方突然傳來(lái)元太的喊聲，地板轟然洞開(kāi)。少年偵探團(tuán)舉著熒光苔蘚燈從密道沖出）
光彥：（翻開(kāi)古舊日記本）明林姐姐留下的摩爾斯電碼顯示，解藥成分就藏在教堂地窖的...
（琴酒突然甩出匕首擊碎穹頂水晶吊燈，全場(chǎng)陷入黑暗。螢火蟲(chóng)群受驚飛起，在幽藍(lán)微光中拼出DNA螺旋圖案）
灰原哀：（掙扎著踢翻祭壇燭臺(tái)）快走！他們的目標(biāo)是...
（朱蒂老師突然從懺悔室沖出，用柔道術(shù)鎖住苦艾酒。阿笠博士的遙控滑翔翼撞破彩窗，漫天星光傾瀉而下）（匕首破空聲與水晶碎裂聲交織，螢麗蟲(chóng)群的幽藍(lán)冷光中，灰原哀的茶色發(fā)絲掠過(guò)琴酒驟然收縮的瞳孔。赤井秀一的夜視瞄準(zhǔn)鏡里，突然映出三枚高速旋轉(zhuǎn)的金屬骰子——那是基安蒂的狙擊定位器）
灰原哀：（在傾倒的燭火中翻滾）密碼是動(dòng)態(tài)變量！快毀掉吊墜的量子糾纏裝置！
（步美頸間的螢火蟲(chóng)吊墜突然迸發(fā)強(qiáng)光，安室透的戰(zhàn)術(shù)手套在灼燒中仍精準(zhǔn)抓住墜子。教堂地窖傳來(lái)機(jī)械運(yùn)轉(zhuǎn)聲，二十年前留下的粒子對(duì)撞機(jī)正將解藥分子式刻入螢火蟲(chóng)的線粒體DNA）
琴酒：（扯開(kāi)風(fēng)衣露出纏滿引線的軀體）你們真以為我會(huì)毫無(wú)準(zhǔn)備？（按下懷表倒計(jì)時(shí)）
柯南：（踩著墜落的十字架騰空）博士！電磁脈沖！
（阿笠博士顫抖著按下紅色按鈕，彩窗碎片突然在空中凝滯成晶格陣列。朱蒂鎖著苦艾酒撞向管風(fēng)琴，古老音管奏出的超聲波與螢火蟲(chóng)振翅頻率產(chǎn)生共振）
光彥：（將日記本按在懺悔室銅門(mén)上）原來(lái)如此！紫外線顯影的第三層密碼是克萊因瓶結(jié)構(gòu)！
（元太怒吼著舉起坍塌的祭壇石柱，露出地下實(shí)驗(yàn)室的冷柜群。宮野明美泛黃的實(shí)驗(yàn)日志在寒氣中自動(dòng)翻頁(yè)，泛著磷光的公式沿著螢火蟲(chóng)軌跡滲入灰原哀手腕的抑制環(huán)）
赤井秀一：（突然調(diào)轉(zhuǎn)槍口）波本！你袖口的血跡DNA排列...
安室透：（扯碎染血袖口甩向琴酒）多謝提醒，這可是朗姆的“禮物“！（血液接觸引線瞬間汽化成紫色煙霧）
（苦艾酒在音波沖擊下露出詭異笑容，她的虹膜倒映出教堂外十二個(gè)狙擊紅點(diǎn)。少年偵探團(tuán)的苔蘚燈突然聚合成綠色激光，將水汽蒸騰的空中變成巨大的全息顯影屏）
灰原哀：（掙脫崩解的抑制環(huán)）江戶川！要同時(shí)凍結(jié)三處...
（柯南的增強(qiáng)腳力鞋與赤井的狙擊槍托在空中相撞，迸發(fā)的火花點(diǎn)燃懸浮的晶格。螢火蟲(chóng)群組成的∞符號(hào)開(kāi)始逆時(shí)針旋轉(zhuǎn)，將APTX4869的堿基序列重構(gòu)為逆轉(zhuǎn)錄酶）
琴酒：（看著逐漸透明的左手）原來(lái)這就是“銀色子彈“的真正形態(tài)...（突然將匕首刺入自己心臟）但潘多拉魔盒永遠(yuǎn)需要守門(mén)人！
（鮮血觸地的剎那，整座教堂開(kāi)始量子隧穿。少年偵探團(tuán)手環(huán)上的七色光芒自發(fā)聯(lián)結(jié)成保護(hù)網(wǎng)，而灰原哀在消失的祭壇上抓住了琴酒風(fēng)衣內(nèi)袋的微縮膠片）
步美：（吊墜光芒漸弱）小哀...螢火蟲(chóng)在說(shuō)話...它們說(shuō)明天要去博士家吃鰻魚(yú)飯...
（時(shí)空震蕩達(dá)到頂峰時(shí)，沖矢昴的改裝無(wú)人機(jī)群帶著液氮罐俯沖而下。當(dāng)晨光穿透消散的量子云霧，廢墟中只剩破損的彩玻璃在地面拼出“我們既是上帝也是惡魔“的分子式）
灰原哀：（握緊膠片走向晨霧）永無(wú)止境的斗爭(zhēng)嗎...（突然被柯南拉住手腕）
柯南：（鏡片反光中閃過(guò)數(shù)據(jù)流）不，是永不停歇的追尋。（舉起手機(jī)屏幕上的螢火蟲(chóng)軌跡圖）看，博士已經(jīng)破譯了第一組蛋白質(zhì)折疊序列
（遠(yuǎn)處警笛聲中，少年偵探團(tuán)圍著自動(dòng)販賣機(jī)歡呼。安室透擦拭著新傷口若有所思，而赤井秀一的風(fēng)衣口袋里，半枚染血的金屬骰子正發(fā)出規(guī)律震動(dòng)）
（幕落時(shí)，一只機(jī)械螢火蟲(chóng)從廢墟飛向朝陽(yáng)，它的復(fù)眼里閃爍著APTX4869與解藥的雙螺旋投影）
柯南：（躍上十字架）永別了，黑衣組織！（射出麻醉針）
（追光漸暗，只余螢火蟲(chóng)在夜空中組成∞符號(hào)）
（幕落）《名偵探柯南與宮野明林》全部劇情終2025年4月18日寫(xiě)完