就在徐如意提出內閣制度的第二天，朱允炆便正式下旨，更定官制。

升六部尚書為正一品，升吏部左侍郎杜澤為吏部尚書。

改都察院為御史府，都御史為御史大夫。罷十二道為左、右兩院，左為拾遺，右為補闕。

改通政使司為寺。

詹事府增置資德院。翰林院復